药师琉璃光如来之十二大愿，本是世尊、药师佛的不可思议境界，经云“一切声闻及诸独觉。纵经多劫说不能尽。唯除如来补处菩萨”，我今竟也试解之，可见想法近乎痴顽。怎奈以佛菩萨的威神之力加持，秉情真意切，作空谷之言说。期读者、听众能“如实知自心”，体药师之本怀，我此抛砖也算功不唐捐。是为序。
药师经法的根本在十二大愿，有此根本，药师定才能修入和相应成就。
儒家讲做人在立志，佛法修行首在发愿，发愿就是发菩提心。大乘佛法全部都是在讲菩提心，从因地向果地，又从果地向因地，乃至因果不二、因果一如，都是在菩提心里，发菩提心，行菩提愿，证菩提果。心包含色，色包含心，心色不二。
圣贤讲立志，菩萨讲发愿，实质一也。美国学者、发明家贝尔，总结自己的经历说：“当你想着成功，成功的景象就会在心中形成。”在心理学上，这就是著名的贝尔效应。
（贝尔， 1847.3.3～1922.8.2，美国发明家，电话的发明人。出生于英国的爱丁堡，14岁在爱丁堡皇家中学毕业后，曾在爱丁堡大学和伦敦大学学院听课，主要靠自学和家庭教育。1864年开始声学研究。
贝尔从事研究的范围极广，曾获18种专利，还和其他人一起获得12种专利，其中14种为电话、电报，4种为光电话机，1种为留声机，5种为航空飞行器，4种为水上飞机，还有2种为硒光电池。他丰富的创造性思想，在当时不可能样样都成为现实，他的许多观念到后世才见到成果。）
贝尔效应是讲世间法的常理。那么出世间法的行愿呢？
这句话可改为：当你想着佛，佛的景象就会在你心中形成。
当你学佛，就会成佛。
当你求觉悟，就会成觉悟。
人本具欲，心可发愿。愿与欲，本体是一，用则有异。有我执是欲，无我执是愿；迷则是欲，觉则是愿；识则是欲，智则是愿；业则是欲，密则是愿。
清净行欲，欲即是愿；贪嗔行愿，愿亦成欲。
有药师之十二大愿，才有琉璃光世界，心净佛土净、愿真成就真。
凡欲学药师经法者，必先立药师之大愿，修药师之大定，无我为人，净心行愿，因行真实，果地不虚，必能以色身透法界，以法界透色身，现证药师本尊，圆满成就净琉璃光世界。
近代大德，从太虚大师开始到顾老、赵朴老、吴老等大德，倡导人间佛教、人间净土，这个思想完全与药师十二大愿相应，是特别适合我国当前建设社会主义和谐社会目标的佛法修行。
学佛发愿，有深浅、难易、层次的不同，
最简单说就是：上求下化。
上求诸佛道，下化众生。
再扩展就是四宏誓愿：
众生无边誓愿度，
烦恼无尽誓愿断，
法门无量誓愿学，
佛道无上誓愿成
再又扩展就是普贤菩萨的十大愿王：
一者礼敬诸佛；二者称赞如来；三者广修供养；四者忏悔业障；五者随喜功德；六者请转法錀；七者请佛住世；八者常随佛学；九者恒顺众生；十者普皆回向。
《普贤行愿品》属于《华严经》，全称为《大方广佛华严经入不可思议解脱境界普贤行愿品》。经中最重要的一句话就是，无论发何种愿都是
“念念相续，无有间断；身语意业，无有疲厌。”
这是普贤菩萨为何能“入不可思议解脱境界”的关键，这也是修证入药师定的关键。
以上是讲学佛的通愿。我们现在讲药师琉璃光如来十二大愿，是别愿。还有阿弥陀佛四十八大愿、地藏菩萨等的愿，也是别愿。通愿别愿，都能够互摄互入的，都是从大日如来的法身功德所流出。我们学药师十二大愿，一一都能包括普贤的十大愿，特别是普贤第九恒顺众生的愿，广开就是药师佛的十二大愿。
从果地法门说，愿就包含了戒、定、慧，所谓才发菩提即成证觉。密乘是以愿为戒，三昧耶戒就叫平等本誓。学哪个佛、哪个菩萨，就是以他的愿为戒，这样修本尊法才会得大成就。所以我们讲平等发愿门，不是从浅的求佛消灾除难开始，是反过来从学发药师佛的愿开始，是高起点的发愿。
或有人问：我目前还发不了这么大的愿，我只想得到佛经中所说的利益，十法门随做其中一部份，可不可以？当然可以。只要有一种如法的善行，也能得药师法的利益，且逐渐地发起圆满的行愿，但这样的成就是有限的、有为的且时间漫长。
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